预付款保函：
是指担保人(保证人)根据申请人(合同中的施工方)的要求向受益人(合同中的发包人)开立的，保证一旦申请人未能履约，或者未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺
分离式保函：
是指银行、保险公司、担保公司或担保人应申请人(一般为担保公司)的请求，为被担保人(主合同的一方)向受益人开立的一种书面信用担保凭证，保证在被保证人未能按双方协议履行其责任或义务时，由担保人代其向受益人履行一定金额、一定时限范围内的某种支付或经济赔偿责任
预付款保函的有效期：
一般按合同，银行长一般提供24个月担保时间，如果继续要提供履约保函，要再行申请，而且银行方面也会向接受履约保函方提出到期的公函。承包商履约担保的有效期是在合同中约定的。合同约定的有效截止时间一般为工程建设合同约定的工程竣工验收合格之日后30天至180天。
预付款保函与履约保函的区别：
履约保函是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容
预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
也就是说这是两个不同的保函，都是要交的。因此从某一个角度也能体现施工单位的经济实力。
不过不用担心，作为预付款的保函既然是为了保证预付款的，就不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。