办理银行保函一般有两种形式，一种是占用企业本身的授信额度，直接去银行办理（很多企业在银行并没有授信额度），这种需要给银行缴纳一定的保证金，通过银行审核后会出具银行保函。
另一种是通过担保公司来办理银行保函，出具一定的手续费，使用担保公司在银行的授信额度来办理。通常这种方式要比直接去银行办理要快很多，快的能2-3天出函，当然也有当天出函的。此外，通过担保公司来办理银行保函同样可以解决企业资金周转困难的难题，能够让企业更多的资金用在工程建设和贸易采购上边。
工程建设领域仅存的四个保证金之一，其核心作用是施工项目中，甲方向乙方支付工程预付款后，为保障乙方按质按量进行工程实施，而要求乙方向甲方提供保证金。根据《办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》，预付款保证金可以采用银行保函的形式缴纳。
预付款银行保函是指以银行信用为担保，由银行向甲方出具的担保函，但乙方违约时，由银行向甲方进行赔付。目前，预付款银行保函主要是建设银行开具，支持全国使用。也有部分甲方要求必须为当地银行开具的，这种情况可以通过担保公司代为办理。同时，部分项目会要求采用基本户所在银行开具的保函，如果基本户所在银行不提供银行保函办理业务，可以通过担保公司代为办理。